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多组学分析、整合、联用-分子机制的新方向

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多组学分析、整合、联用-分子机制的新方向 027-88189683 | marketing@genecreate.com | English 简体中文 登录  /  注册    关注微信 菜单 首 页 关于金开瑞 公司简介 总经理寄语 专家团队 宣传视频 组织框架 企业文化 荣誉资质 科研成果 技术服务 基因服务 常规基因合成 快速基因合成 定点突变 亚克隆 载体构建 质粒DNA制备 酵母双/单杂交 引物合成 普通引物合成 修饰/标记引物合成 RNA合成 基因组/代谢组 三维基因组 ATAC-seq 代谢组学 蛋白表达/抗体定制 蛋白表达 抗体纯化 多克隆抗体定制 保证型单克隆抗体定制 保证型多克隆抗体定制 噬菌体平台服务定制 单克隆抗体定制 抗体修饰 小分子抗体定制 免疫试剂盒及胶体金定制 重组抗体表达 检测分析服务 免疫学检测 细胞学检测 分子生物学检测 双荧光素酶报告基因 病毒包装 腺病毒包装 慢病毒包装 腺相关病毒包装 稳转细胞株构建 蛋白质组学分析 iTRAQ定量蛋白质组学 SWATH定量蛋白质组学 SILAC定量蛋白质组学 Label-free定量蛋白组学 相互作用蛋白质组 蛋白质组全谱鉴定 目标蛋白质组分析 磷酸化蛋白质组鉴定 蛋白翻译后修饰位点鉴定 蛋白胶点、胶条鉴定 蛋白复合体鉴定 MRMHR/PRM 综合项目服务 FISH RIP RNA pull lanugo GST pull-down miRNA靶基因的预测与验证 lncRNA研究 研究方案 表观遗传机制 非编码RNA 多组学联用 外泌体 细胞研究 基因编辑 分子互作研究 技术支持 常见问题与解答 技术专题 合作流程 下载中心 新闻中心 公司新闻 行业动态 促销信息 联系我们 联系方式 招贤纳士 您现在所在的位置：主页 > 研究方案 > 多组学联用     研究方案 多组学联用 基因组学 转录组学 蛋白组学 代谢组学 多组学联合分析 基因组研究包括两方面的内容：以全基因组测序为目标的结构基因组学（structural genomics）和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学（functional genomics)，又被称为后基因组（postgenome）研究，是系统生物学的重要方法。 在医学领域，基因组学能为一些疾病提供新的诊断、治疗方法，有助于医生获得更多的治疗信息并进行个性化医疗。在食品、农业、环境等研究领域，基因组学的应用也十分广泛。基因组学的主要工具和方法包括生物信息学，遗传分析，基因表达测量和基因功能鉴定。 服务内容： 16s、18s、ITS等扩增子测序 外显子组测序 单细胞测序 Hi-C技术 转录组即某个物种或特定细胞在某一功能状态下产生的所有RNA的总和，是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是，转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下，其基因表达情况是不完全相同的 。 转录组测序是指利用第二代高通量测序技术进行cDNA测序，全面快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本。相对于传统芯片而言，转录组测序无需预先设计探针，即可对任意物种的任意细胞类型的转录组进行检测，能够提供更精确的数字化信号，更高的检测通量以及更广泛的检测范围，是目前深入研究转录组复杂性的强大工具。 服务内容： mRNA测序 lncRNA测序 small RNA测序 cirRNA测序 蛋白质组（proteome）是指一个细胞或一个组织基因组所表达的全部蛋白质总和，而蛋白质组学是指利用各种技术手段来研究蛋白质组的一门新学科，其主要目的是研究生物体内所有蛋白质的种类、表达水平、修饰状态，了解蛋白质之间的相互作用与联系，揭示蛋白质功能与生命活动的规律。 服务内容： 单一蛋白鉴定 胶点/胶条鉴定 翻译后修饰位点鉴定 发现蛋白质组学 全谱鉴定 比较蛋白质组学 iTRAQ label-free SILAC SWATH 修饰蛋白质组学 磷酸化、乙酰化、泛素化、糖基化 靶向蛋白质组学 MRMHR/PRM “基因组学和蛋白质组学告诉你什么可能发生，而代谢组学则告诉你什么确实发生了”—Bill Lasley，UC Davis 生命科学研究日新月异，基因组次及相关分析技术的提高极大地推动力转录组学、蛋白质组学、代谢组学、表型组学等的快速发展，人们可以采用系统集成的手段，多层次揭示生命现象。这种研究的思路和方法催生了系统生物学。代谢组学是系统生物学的重要组成部分，代谢物与表型最为接近，代谢物的变化更直接地揭示基因的功能。因此代谢组学研究越来越受到广泛的关注，代谢组学手段在解析生物系统及基因功能等方面也发挥着越来越重要的作用。 代谢组（metabolome）：指参与生物体新陈代谢、维持生物体正常生长功能和生长发育的小分子化合物的集合，主要是相对分子量小于1000的内源性小分子。 代谢组学（Metabolomics）：指对某一生物、组织或细胞中所有低分子量（通常指MV＜1000）代谢产物进行定性和定量分析的一门科学。 非靶标代谢组学 非靶向代谢组学又称为发现代谢组学，主要是将对照组和实验组的代谢组（某一生物体的全 部代谢物）进行比对，以找出其代谢物的差异，主要分为医学代谢组学、植物代谢）组学、微生物代谢组学、药物代谢组学及脂质代谢组学。 技术流程 采样   代谢物的提取   上机检测（GC-MS、LC-MS、NMR）   数据预处理（信息峰提取、识别）   多元变量统计分析（PCA、PLS-DA、OPLS-DA）   深度数据挖掘（代谢通路分析，关联分析） 数据分析内容 基本数据分析 数据预处理 PCA分析 PLS-DA分析 OPLS-DA分析 差异化合物筛选 差异化合物鉴定 高级数据分析 多组分关联分析（同一标本同时取多组分） 代谢通路分析 代谢网络分析 多组学数据关联分析（具备多组学数据） 应用领域 差异代谢物寻找筛选、疾病发病机制研究、药物治疗机制研究。 靶标代谢组学 主要是以标准品为参照，对特定的代谢物群进行有针对性地、特异性地检测与分析。相对于全代谢组分析而言，靶向代谢组分析具有特异性强，检测灵敏度高和定量准确等几个特点,主要包括LC-MS靶标代谢组学/GC-MS靶标代谢组学。 技术流程 规范取样   样品冻干   样品提取   上机跑样检测   下机数据分析 应用领域 验证由发现代谢组学实验提出的假说 进行基于假说的探索性实验（通常根据最新的解释），针对特定代谢物，研究代谢模型 近年来随着新技术的不断涌现，加快了多组学研究向定量化，高通量的发展，特别是在单细胞层次研究基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学，已成为人们发现生命化学物质基础和深入了解其分子机制的新方向。 通过对多组学数据的整合分析，有利于系统性地研究临床发病机理、确认疾病靶点，发现生物标志物与进行疾病早期诊断，从而对个体化治疗和用药指导发挥重要作用。 v 核酸组学：从底层原因层面探究和解决生物学问题 v 蛋白组学：从表层原因层面探究和解决生物学问题 v 代谢组学：从分子性状及结果层面探究和解决生物学问 多层组学整合：组学发展的新趋势，结果更可靠、数据更丰富 组学研究整体框架 技术流程 案例分析 案例一：蛋白质组+转录组 参考文献：Cabezas-Wallscheid N ,Klimmeck D, et al. Identification of Regulatory Networks in HSCs and Their Immediate Progeny via Integrated Proteome, Transcriptome, and DNA Methylome Analysis[J]. Cell Stem Cell , 2014 , 15 (4) :507-22 文章内容：文章针对造血干细胞（hematopoietic stem cells，HSCs)及四种多能祖细胞群（multipotent progenitor，MPP）的定量蛋白质组、转录组及甲基化分析数据进行了整合分析。从鉴定到的27000余条转录本，6000余个蛋白和15000余段差异甲基化区域（differentially methylated regions，DMRs）中，分析出与早期分化相关的协同作用的分子变化。文章数据揭示出493种转录因子的转录本与628条lncRNA的差异表达图谱，并找出了HSCs中重点的特异表达群。同时还发现了在HSCs分化过程中的起关键作用的转录本亚型动态调控模式，以及与MPP2细胞多能性相关的细胞周期/DNA修复特征。文章在造血层级系统的顶层提供了一个综合的全基因组的分析资料，便于探讨涉及分子、细胞、表观遗传的机制调控。 图1. 转录组及蛋白质组差异表达分析 图2. 基因表达特征谱及转录本亚型调控 案例二：转录组+蛋白质组+代谢组 参考文献： Quirós PM , Prado MA, et al. Multi-omics wringer identifies ATF4 as a key regulator of the mitochondrial stress response in mammals[J]. Journal of Cell Biology , 2017 , 216 (7) :2027 文章内容：通过分析四种线粒体应激处理后细胞转录组、蛋白质组和代谢组的变化，发现ATF4基因是线粒体应激调控的关键基因。 图1：低通量手段检测四种处理引起的线粒体功能变化 图2. 基因表达特征谱及转录本亚型调控 图3：代谢组差异分析及通路示意图 图4：下调蛋白的韦恩图与KEGG通路富集图 技术服务 基因服务 引物合成 蛋白质组学 病毒包装 蛋白表达 抗体定制 检测分析服务 综合项目服务 研究方案 非编码RNA 表观遗传机制 多组学联用 基因编辑 外泌体 细胞研究 下载中心 订单 询价信息表 技术手册 其他 联系我们 联系方式 加入我们 新版网站 网站地图 友情链接 武汉生之源生物 elisa试剂盒 Cusabio 科赛格 福来生物 酶联免疫试剂盒 华美生物 Flairebio 丁香通 来宝网 Copyright © 2007-2014 武汉金开瑞生物工程有限公司　版权所有　鄂ICP备13017366号-2